indraja: (Default)
[personal profile] indraja
Gelių dokumentavimo aparatas neveikė, tad šiandien nufotografavau gelį fotoaparatu. Gavosi toli gražu ne taip ryškiai, bet spalvotai. Jei kam nėra tekę susidurti – šie brūkšniukai atitinka skirtingo dydžio DNR fragmentus. Jie migruoja agaroziniame gelyje teigiamo elektrodo link, tai yra, vyksta elektroforezė. Kuo fragmentas mažesnis, tuo greičiau juda, taigi, brūkšniai paveikslėlio dešinėje – mažesni fragmentai, kurie nuėjo toliau. „Kopėčios“ iš krašto – žymeklis, jau žinomo dydžio fragmentų mišinys. DNR gelyje galima matyti todėl, kad jame yra dažo etidžio bromido, o gelis peršviečiamas ultravioletine šviesa. Tokių gelių išvaizda leidžia identifikuoti DNR molekules, nes galima palyginti fragmentus, kuriuos turėtume gauti tam tikrais atvejais, su fragmentais, kuriuos gavome. DNR sukarpoma į gabalus fermentais restriktazėmis (restrikcijos endonukleazėmis), kurie atpažįsta tam tikras, paprastai palindromines, „raidžių“ – nukleotidų sekas. Jei molekulės nukleotidų seka žinoma, žinosime, kokius fragmentus turime gauti po skaidymo konkrečiu fermentu.

Minėtu aparatu gautas ryškus gelio atvaizdas pirmoje nuotraukoje žemiau, o antroje nuotraukoje – tikrosios spalvos.

Smalsu: kas iš šio pasakojimo sužinojo šio to naujo, o kam visa tai ir taip buvo žinoma?

Аппарат для документирования гелей не работал, так что сегодня сфотографировала гель фотоаппаратом. Получилось не так чётко, зато в цвете. Если кто не сталкивался, то эти чёрточки соответствуют фрагментам ДНК разной величины. Они мигрируют в агарозном геле к положительному электроду, то есть, происходит электрофорез. Чем фрагмент меньше, тем быстрее, так что чёрточки на правой стороне картинки – это фрагменты поменьше, которые ушли дальше. «Лестница» с краю – маркер, смесь фрагментов уже известной величины. ДНК в геле можно увидеть потому, что в нём содержится краситель бромистый этидий, а гель тут просвечивается ультрафиолетовым светом. Вид таких гелей позволяет идентифицировать ДНК, так как можно сравнить фрагменты, которые должны были получиться в каком-то случае, с теми, которые получились. ДНК разрезывается на куски ферментами рестриктазами (эндонуклеазами рестрикции), которые опознают определённые, обычно палиндромные, последовательности «букв» – нуклеотидов. Если нуклеотидная последовательность молекулы известна, будем знать, какие фрагменты получим при помощи конкретного фермента.

Чёткое изображение геля, полученное упомянутым аппаратом, на первой фотографии внизу, а второе фото в естественных цветах.

Любопытно: кто из этого рассказа узнал нечто новое, а кто и так про всё это знал?




This account has disabled anonymous posting.
(will be screened if not validated)
If you don't have an account you can create one now.
HTML doesn't work in the subject.
More info about formatting

Profile

indraja: (Default)
Indraja

October 2025

M T W T F S S
  12345
6789101112
13141516171819
20212223242526
27 28293031  

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jan. 27th, 2026 10:06
Powered by Dreamwidth Studios