indraja: (Default)
[personal profile] indraja
Gelių dokumentavimo aparatas neveikė, tad šiandien nufotografavau gelį fotoaparatu. Gavosi toli gražu ne taip ryškiai, bet spalvotai. Jei kam nėra tekę susidurti – šie brūkšniukai atitinka skirtingo dydžio DNR fragmentus. Jie migruoja agaroziniame gelyje teigiamo elektrodo link, tai yra, vyksta elektroforezė. Kuo fragmentas mažesnis, tuo greičiau juda, taigi, brūkšniai paveikslėlio dešinėje – mažesni fragmentai, kurie nuėjo toliau. „Kopėčios“ iš krašto – žymeklis, jau žinomo dydžio fragmentų mišinys. DNR gelyje galima matyti todėl, kad jame yra dažo etidžio bromido, o gelis peršviečiamas ultravioletine šviesa. Tokių gelių išvaizda leidžia identifikuoti DNR molekules, nes galima palyginti fragmentus, kuriuos turėtume gauti tam tikrais atvejais, su fragmentais, kuriuos gavome. DNR sukarpoma į gabalus fermentais restriktazėmis (restrikcijos endonukleazėmis), kurie atpažįsta tam tikras, paprastai palindromines, „raidžių“ – nukleotidų sekas. Jei molekulės nukleotidų seka žinoma, žinosime, kokius fragmentus turime gauti po skaidymo konkrečiu fermentu.

Minėtu aparatu gautas ryškus gelio atvaizdas pirmoje nuotraukoje žemiau, o antroje nuotraukoje – tikrosios spalvos.

Smalsu: kas iš šio pasakojimo sužinojo šio to naujo, o kam visa tai ir taip buvo žinoma?

Аппарат для документирования гелей не работал, так что сегодня сфотографировала гель фотоаппаратом. Получилось не так чётко, зато в цвете. Если кто не сталкивался, то эти чёрточки соответствуют фрагментам ДНК разной величины. Они мигрируют в агарозном геле к положительному электроду, то есть, происходит электрофорез. Чем фрагмент меньше, тем быстрее, так что чёрточки на правой стороне картинки – это фрагменты поменьше, которые ушли дальше. «Лестница» с краю – маркер, смесь фрагментов уже известной величины. ДНК в геле можно увидеть потому, что в нём содержится краситель бромистый этидий, а гель тут просвечивается ультрафиолетовым светом. Вид таких гелей позволяет идентифицировать ДНК, так как можно сравнить фрагменты, которые должны были получиться в каком-то случае, с теми, которые получились. ДНК разрезывается на куски ферментами рестриктазами (эндонуклеазами рестрикции), которые опознают определённые, обычно палиндромные, последовательности «букв» – нуклеотидов. Если нуклеотидная последовательность молекулы известна, будем знать, какие фрагменты получим при помощи конкретного фермента.

Чёткое изображение геля, полученное упомянутым аппаратом, на первой фотографии внизу, а второе фото в естественных цветах.

Любопытно: кто из этого рассказа узнал нечто новое, а кто и так про всё это знал?




Date: 2012-11-11 13:29 (UTC)
From: [identity profile] u-uka.livejournal.com
ужОс какой.
(*сидит и чувствует себя селом неасфальтированным*)

Слушай, а ты не хочешь как-нибудь серию постов про работу написать. Со слайдами и городскими легендами там. Мне твоя работа нааааастолько интересной кажется. Я б читала, как детектив.
Не знаю, я ли одна такая.

Profile

indraja: (Default)
Indraja

October 2025

M T W T F S S
  12345
6789101112
13141516171819
20212223242526
27 28293031  

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jan. 27th, 2026 11:00
Powered by Dreamwidth Studios